超聲波清洗機在進行操作時所要使用的清洗方法，在一定程度上判斷應用水性清洗液還是溶劑，終需做清洗實驗。只有這樣，才能提供合適的清洗系統、設計合理的清洗工序以及清洗液。
超聲波清洗機化學藥劑的選擇
超聲波清洗機在進行使用時考慮到清洗液的物理特性對其超聲清洗的影響，其中蒸汽壓、表面張力、黏度以及密度應為顯著的影響因素。溫度能影響這些因素，所以它也會影響空化作用的效率。任何清洗系統必須使用清洗液。水性系統通常由敞口槽組成，工件浸沒其中。而復雜的系統會由多個槽組成，并配備循環過濾系統、沖淋槽、干燥槽以及其它附件。
超聲波清洗機在一定程度上對于使用溶劑的系統，其多數為超聲波汽相除油脂清洗機，常配備廢液連續回收裝置。超聲波汽相清除油脂過程是由溶劑蒸發槽和超聲浸洗槽組成的集成式多槽系統完成的。在熱的溶劑蒸汽和超聲激蕩共同作用下，油、脂、蠟以及其他溶於溶劑的污垢就被除去。經過一系列清洗工序后下料的工件發熱、潔凈、干燥。
超聲波清洗機選擇清洗液時需要考慮的因素
清洗效率：選擇有效的清洗溶劑時，一定要作實驗。如在現有的清洗工藝中引入超聲，所使用的溶劑一般不必變更；
操作簡單：所使用的液體應安全無毒、操作簡單且使用壽命長；
成本：廉價的清洗溶劑的使用成本并不一定。使用中必須考慮到溶劑的清洗效率、安全性、一定量的溶劑可清洗多少工件利用率等因素。當然，所選擇的清洗溶劑必須達到清洗效果，并應與所清洗的工件材料相容。水為普通的清洗液，故使用水基溶液的系統操作簡便、使用成本低、應用廣泛。然而對於某些材料以及污垢等并不適用於水性溶液，那么還有許多溶劑可供選用。