超聲波清洗機在工作的過程中其頻率是很低的，這樣就會產生噪音，在運行時當頻率低于20kHz時，在進行工作的過程中其噪音不僅變的很大，在一定程度上也可能會超出職業安全和保健法或其它條例所規定的安全噪音的限度。在需要高功率去除污垢而不用考慮工件表面損傷的應用中，通常選擇從20kHz到30kHz范圍內的較低清洗頻率。
超聲波清洗機的低頻通常會被有效的用于清洗較小或者是比價精密的零件，在進行使用時清除其微笑顆粒，其高頻還有效的被用于工件表面不允許損傷的應用，
使用高頻可從幾個方面改善清洗性能。隨著頻率的增加，空化泡的數量呈線形增加，從而產生更多更密集的沖擊波使其能進入到更小的縫隙中。
超聲波清洗機在一定程度上要是其功率保持不變且空化泡變小，這樣在一定程度上其釋放的能量就會相應的減少，這樣有效地減小了對工件表面的損傷。高頻的另一個優勢在于減小了粘滯邊界層。
超聲波清洗機的空化作用在一定程度上主要就是超聲波以每秒兩萬次以上的壓縮力和減壓力交互性的高頻變換方式向液體進行透射。在減壓力作用時，液體中產生真空核群泡的現象，在壓縮力作用時，真空核群泡受壓力壓碎時產生強大的沖擊力，由此剝離被清洗物表面的污垢，從而達到精密洗凈目的。
超聲波清洗機的加速度液體粒子推動產生的加速度，在一定程度上對于其頻率較高的超聲波清洗機，在使用時其空化作用就會很不顯著了，這時的清洗主要靠液體粒子超聲作用下的加速度撞擊粒子對污物進行超精密清洗。